PHP 呼叫 R 整合教學，線上資料分析與繪圖工具開發[轉載自GTW]

PHP 執行外部 R 指令稿

建立一個 PHP 指令稿，將其命名為 r.php，內容如下：

https://blog.gtwang.org/r/integrating-php-and-r/ 

(第一張圖)

上面這段程式碼的上半部是一個普通的 HTML form，可以用來送出使用者所輸入的參數，而下半部則是 PHP 的程式碼，在接收使用者輸入的 n 值之後，透過 PHP 的exec 執行外部程式，而 Rscript 這個程式則是附屬在 R 中的一個程式，只要安裝好 R 之後系統上就會有這個程式，它是專門用來執行 R 指令稿的工具程式。

最後在執行完 R 指令稿之後，要顯示繪圖的結果，由於我們每一次所繪製的圖檔檔名都一樣，所以需要在圖檔後方加上一串亂數，強迫讓瀏覽器重新抓取新的圖檔（也就是不要使用瀏覽器的快取），這樣每次送出新的 n 值才會顯示新的結果。

以下是 script.R 這一個 R 指令稿的內容：

https://blog.gtwang.org/r/integrating-php-and-r/ 

(第二張圖)

在 R 中我們透過 commandArgs 取得從 shell 中傳入的參數，其中第一個參數就是使用者輸入的 n 值，藉由這樣的方式就可以取得從 PHP 傳過來的資料。接著產生一些常態分佈的亂數資料，並繪製一張直方圖，我們將圖形儲存至 output 這個目錄中，然後再讓網頁直接讀取這個圖檔，這樣就可以將結果傳給使用者。

這裡我是規劃 output 目錄專門用來放置輸出的圖檔，由於 R 的指令稿會以執行網頁伺服器的使用者（在 Ubuntu Linux 中通常是 www-data）權限來執行，所以請注意目錄權限的設定，要讓伺服器有權限可以寫入這個目錄。

PHP 開啟管線執行 R 指令稿

以 PHP 的 exec 執行外部的 R 指令稿是一個比較簡單的方式，不過缺點就是它需要另外建立一個單獨的 R 指令稿，如果不想要另外建立一個 R 檔案，可以改用proc_open 的方式，直接把 R 的指令從 PHP 中透過 Linux 的管線（pipe）寫到 R 的行程（process）中，這樣就可以省去建立 R 檔案的麻煩，以下是一個簡單的範例：

https://blog.gtwang.org/r/integrating-php-and-r/

(第四張圖)

這個範例我們利用 proc_open 從 PHP 中開啟一個 R 的行程，在開啟新的行程之前，要先以 $descriptorspec 設定好新行程的標準輸入、標準輸出與標準錯誤，此處我們將新 R 行程的標準輸入指定為管線，方便我們直接從 PHP 寫入資料，而 R 的輸出與錯訊息則是導入兩個暫存檔中，通常在開發階段這樣可以方便我們檢視程式是否有正確執行，除錯也比較方便。

將 R 的指令都寫入 R 的行程之後，在呼叫 proc_close 關閉 R 行程之前，要記得先將所有的管線關閉，避免造成 deadlock。最後一樣照舊將圖檔顯示在網頁上，不管是使用 proc_close 還是 exec 來整合 PHP 與 R，顯示出來的效果看起來都相同，只有內部的程式結構上有些差異而已。